Biodiversité, des clés pour agir n°5

Article « Vers une lutte biologique pour conserver le tamarin des Hauts » (pp. 4-5) » (pp. 6-9)
Le Roux, J.-J., Strasberg, D., Rouget, M., Morden, C.W., Koordom, M. & Richardson, D.M. 2014. Relatedness defies biogeography: The tale of two island endemics (Acacia heterophylla and A. koa). New Phytologist 204(1): 230-242.
Ouvrard, D., Streito, J.-C., Clain, C., Fontaine, R. & Germain, J.-F., 2016. Acizzia uncatoides (Psyllidae) et Furcaspis biformis (Diaspididae) nouveaux pour l’île de la Réunion (Hemiptera). Bulletin de la Société entomologique de France 121 (3) : 283-284.
Sicard, G. 2011. Régénération du Tamarin des Hauts à objectif de production. Guide technique, Direction régionale de l’ONF. La Réunion. 64 p.
Strasberg, D., Rouget, M., Richardson, D.M., Baret, S., Dupont, J., & Cowling, R.M. 2005. An assessment of habitat diversity and transformation on La Réunion Island (Mascarene Islands, Indian Ocean) as a basis for identifying broad-scale conservation priorities. Biodiversity & Conservation 14(12): 3015-3032.

Article « Estimer l’effort d’échantillonnage de réseaux participatifs : l’exemple du réseau Loup-lynx » (pp. 6-9)
Duchamp, C., Boyer, J., Briaudet, P.-E. et al. 2012. A dual frame survey to assess time- and space-related changes of the colonizing wolf population in France. Hystrix 23: 1-12.
Kindberg, J., Ericsson, G. & Swenson, J.E. 2009. Monitoring rare or elusive large mammals using effort-corrected voluntary observers. Biological Conservation 142: 159-165.
Louvrier, J., Duchamp, C., Lauret, V. et al. 2018. Mapping and explaining wolf recolonization in France using dynamic occupancy models and opportunistic data. Ecography 41: 647-660.
Sicacha-Parada, J., Steinsland, I., Cretois, B. & Borgelt, J. 2020. Accounting for spatial varying sampling effort due to accessibility in Citizen Science data: A case study of moose in Norway. Spatial Statistics: 100446.
Wang, H. & Song, M. 2011. Ckmeans.1d.dp: Optimal k-means clustering in one dimension by dynamic programming. The R Journal Vol.3(2): 29-33.

Article « Le financement participatif : un outil de mobilisation au service de la biodiversité » (pp. 12-14)
Bpi France, Observatoire Don. Consulté le 08/11/2022.
Bugnet A. & Liberge, M. 2022, Le financement participatif au service de la biodiversité, état des lieux.
CGDD. 2018. Parcs nationaux. Quelles pistes de financements additionnels ? Collection Théma Analyse – Biodiversité. 172 p.
Fédération des Conservatoires d’espaces naturels. 2022. Financements participatifs et Réseau CEN, note interne.
Financement Participatif France et Mazars. 2022. Baromètre du crowdfunding en France.
France générosités. 2022. Baromètre de la générosité 2021.
Parc national des Pyrénées. 2018. Réintroduction du bouquetin ibérique dans le Parc National des Pyrénées, Bilan des actions réalisées entre 2014 et 2017.

Article « Pour une prise en compte de la diversité génétique dans les actions de gestion » (pp. 15-17)
1/ Imbert, E., Ducrettet, J. & Maurice, S. 2021. Gestion de la diversité génétique pour la conservation in situ des espèces végétales - Synthèse des principes fondamentaux et préconisations. Université de Montpellier (UM), FRA; Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier.
2/ Soubelet, H., Couvet, D. & Goffaux, R. 2023. Regard de la FRB sur La COP 15 et le nouveau Cadre mondial pour la biodiversité. Fondation pour la Recherche sur la Biodiversité (FRB). Regard R106, édité par Anne Teyssèdre.
3/ Ducrettet, J., Maurice, S. & Imbert, E. 2023. How much do we know and how much do we care about genetic diversity of threatened plants? A case study from the French flora. Botany Letters 170(1): 110-118.
4/ http://www.reseda-flore.eu/src/home/index.php
5/ Ducrettet, J., Maurice, S., Meslin, L. & Imbert, E. 2022. Méthodes de caractérisation génétique des populations végétales - Aide à la construction d'un protocole de renforcement. [Rapport de recherche] Université de Montpellier (UM), FRA; Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier. 2022.
6/ Soulé, M.E. & Mills, L.S. 1998. No Need to Isolate Genetics. Science 282: 1658-1659.

Lexique

• Adaptation locale : caractérise une meilleure performance des individus dans la localité dont ils sont originaires par rapport à celle des individus issus d'une autre localité. L'échelle spatiale associée est souvent celle qui délimite les populations. Par extrapolation, l'adaptation locale désigne aussi une meilleure performance des individus dans leur localité d'origine par rapport à leur performance dans une autre localité.
• Dépression d’allofécondation : baisse de valeur sélective des descendants issus d'un croisement entre individus éloignés génétiquement par rapport aux descendants issus d'un croisement entre individus plus proches génétiquement. Par extension, baisse de valeur sélective de descendants issus de croisements entre deux populations.
• Dépression de consanguinité : baisse de valeur sélective des descendants issus d'un croisement d'individus proches génétiquement par rapport aux descendants issus d'un croisement entre individus plus éloignés génétiquement. La baisse de valeur sélective résulte de l'état homozygote d'allèles délétères récessifs ou partiellement récessif.
• Dérive : fluctuation des fréquences alléliques due à l'échantillonnage aléatoire des gamètes participant à la formation de la génération suivante. Une conséquence est que certains allèles sont perdus de manière aléatoire.
• Diversité génétique : quantité de variation d’origine génétique. Elle est liée au nombre et à la fréquence des allèles à chaque locus. L’un des paramètres les plus utilisés pour estimer la diversité génétique est l’hétérozygotie attendue. Ce paramètre représente le taux d’hétérozygotes que l’on obtiendrait si les individus se croisaient au hasard.
• Mal-adaptation : état d’une population qui s’écarte de l’état optimal.
• Migration assistée : apport d’individus (ou de gènes) réalisé lors d’une action de gestion.
• Potentiel évolutif : capacité des populations à résister par évolution à un changement environnemental d’origine biotique (prédateurs, parasites…) ou abiotique (sécheresse…) sur la base de sa diversité génétique.  A ne pas confondre avec la résilience des individus (plasticité).
• Récessif : état d’un caractère qui sera exprimé uniquement quand l’allèle responsable de ce caractère est à l’état homozygote.
• Stochasticité démographique : variation aléatoire de la survie et de la reproduction des individus. Entraîne une fluctuation du taux de croissance des petites populations, par contre son effet sur le taux de croissance des grandes populations est généralement négligeable.
• Taille efficace : nombre d'individus qui vont contribuer à la prochaine génération, pondérés par l'importance de leur participation. L'échantillonnage aléatoire des gamètes participant à la formation de la génération suivante s'applique sur la taille efficace. La taille efficace détermine la vitesse d'érosion génétique, qui est d'autant plus rapide que la taille efficace est réduite.
• Variance de reproduction entre individus : estimation de la différence entre individus d’une même population d’un paramètre représentant le succès reproducteur individuel. Dans une population où des individus participent peu à la reproduction comparativement à d’autres individus, l’érosion génétique sera plus rapide.

Article « Les enjeux de la conservation des mammifères marins » (pp. 22-24)
Authier, M., Spitz, J., Blanck, A. & Ridoux, V. 2017. Conservation Science for Marine Megafauna in Europe: Historical Perspectives and Future Directions. Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography 141: 1-7.

Article « Les activités humaines : première cause directe de mortalité des cétacés » (p. 25)
1/ Rojas-Bracho, L. & Reeves, R.R. 2013. Vaquitas and gillnets: Mexico’s ultimate cetacean conservation challenge. Endang. Species Res. 21: 77-87.
2/ Turvey, S.T., Pitman, R.L., Taylor, B.L. et al. 2007. First human-caused extinction of a cetacean species? Biol. Lett. 3: 537–540.
3/ Secchi, E.R., Cremer, M.J., Danilewicz, D. & Lailson-Brito, J. 2021. A Synthesis of the Ecology, Human-Related Threats and Conservation Perspectives for the Endangered Franciscana Dolphin. Front. Mar. Sci. 8.
4/ Slooten, E. & Dawson, S.M. 2021. Delays in Protecting a Small Endangered Cetacean: Lessons Learned for Science and Management. Front. Mar. Sci. 8.
5/ ICES. 2021. Workshop on estimation of MOrtality of Marine MAmmals due to Bycatch (WKMOMA). ICES Scientific Reports 3: 106.
6/ ICES. 2020. 01 2020 Report Working Group for the Bay of Biscay and the Iberian Waters Ecoregion.
7/ Popov, D., Meshkova, G., Vishnyakova, K. et al. 2023. Assessment of the bycatch level for the Black Sea harbour porpoise in the light of new data on population abundance. Front. Mar. Sci. 10.
8/ Laist, D.W., Knowlton, A.R., Mead, J.G. et al. 2001. Collisions Between Ships and Whales. Mar. Mammal Sci. 17: 35-75.
9/ Corkeron, P., Hamilton, P., Bannister, J. et al. 2018. The recovery of North Atlantic right whales, Eubalaena glacialis, has been constrained by human-caused mortality. R. Soc. Open Sci. 5: 180892.
10/ Laran, S., Pettex, E., Authier, M. et al. 2017. Seasonal distribution and abundance of cetaceans within French waters. Part I: The North-Western Mediterranean, including the Pelagos sanctuary. Deep Sea Research Part II: Topical Studies in Oceanography 141: 20-30.
11/ Panigada, S., Pesante, G., Zanardelli, M., et al. 2006. Mediterranean fin whales at risk from fatal ship strikes. Mar. Pollut. Bull. 52: 1287-1298.
12 Peltier, H., Beaufils, A., Cesarini, C. et al. 2019. Monitoring of Marine Mammal Strandings Along French Coasts Reveals the Importance of Ship Strikes on Large Cetaceans: A Challenge for the European Marine Strategy Framework Directive. Front. Mar. Sci. 6.
13 Balcomb, K.C.I. & Claridge, D.E. 2001. A mass stranding of cetaceans caused by naval sonar in the Bahamas. Bahamas J. Sci. 8: 2-12.
14 Bernaldo de Quirós, Y., Fernandez, A., Baird, R.W. et al. 2019. Advances in research on the impacts of anti-submarine sonar on beaked whales. Proc. R. Soc. B Biol. Sci. 286: 20182533.

Article « Les pressions secondaires ; facteurs d’affaiblissement des populations de mammifères marins » (p.29)
Hall, A.J., Hugunin, K., Deaville, R. et al. 2006. The Risk of Infection from Polychlorinated Biphenyl Exposure in the Harbor Porpoise (Phocoena phocoena): A Case–Control Approach. Environmental Health Perspect. 114(5): 704-711.
Ylitalo, G.M., Stein, J.E., Horm, T. et al.  2005. The role of organochlorines in cancer-associated mortality in California sea lions (Zalophus californianus). Mar Pollut Bull. 50: 30-39.

Article « Le dérangement : une pression toujours plus forte sur les mammifères marins » (p.31)
AAMP. 2009. Tome 1. Sports et loisirs en mer. Activités - Interactions - Dispositifs d’encadrement - Orientations de gestion. Référentiel pour la gestion dans les sites Natura 2000 en mer. Agence des aires marines protégées, novembre 2009. 224 p.
Triplet, P. & Schricke, V. 1998. Les facteurs de dérangement des oiseaux d’eau : synthèse bibliographique des études abordant ce thème en France. Bulletin Mensuel ONC n°235 : 20-27.

Article « Une méthode pour évaluer le potentiel de gain écologique d’un site » (pp. 39-41)
Aubry, S., Gaucherand, S. & Spiegelberger, T. 2020. Pertinence écologique des Sites Naturels de Compensation. Proposition d’une feuille de route méthodologique pour évaluer la pertinence écologique des projets de SNC. Rapport Final. INRAE.
CGDD [Commissariat général au développement durable]. 2017. La séquence « éviter, réduire et compenser », un dispositif consolidé.
CGDD [Commissariat général au développement durable]. 2021.Approche standardisée du dimensionnement de la compensation écologique. Guide de mise en œuvre.
Delzons, O., Cima, V., Fournier, C. et al. 2021.Indice de qualité écologique (IQE) - Indice de potentialité écologique (IPE) - Guide méthodologique Version 2.0. UMS PatriNat OFB-CNRS-MNHN. 118 p.
Moreno-Mateos, D., Power, M. E., Comín, F. A., & Yockteng, R. 2012. Structural and functional loss in restored wetland ecosystems. PLoS Biology 10(1) : Article e1001247.
Regnery, B. 2017. La compensation écologique : concepts et limites pour conserver la biodiversité. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris. 288 p. (Hors collection ; 40).
Salafsky, N., Salzer, D., Stattersfield, A.J. et al. 2008. A standard lexicon for biodiversity conservation: unified classifications of threats and actions. Conservation Biology 22(4): 897-911.

Pour aller plus loin
Article « Plonger les yeux ouverts » (pp. 18-19)
Le retour de Moby Dick - Ou ce que les cachalots nous enseignent sur les océans et les hommes. Editions Actes Sud/Mondes sauvages, 2017.
Réconcilier les hommes avec la vie sauvage. Editions Actes Sud/Domaine du possible, 2021.
Au nom des requins. Editions Actes Sud/Mondes sauvages, 2022.
S'il te plaît, dessine-moi un cachalot. Editions Actes Sud/Mondes sauvages, 2023.