Les enjeux liés à la gestion de l’eau sont considérables en outre-mer. Particulièrement à Mayotte, les ouvrages d’assainissement des eaux usées sont absents ou non-conformes. Par ailleurs, l’eau potable mise à disposition est insuffisante pour satisfaire les besoins d’une population en augmentation constante dans un contexte de changement climatique et de destruction des écosystèmes.
À La Réunion et à Mayotte, l’OFB est engagé dans le rattrapage des services d’eau et dans l’amélioration de la gestion des milieux aquatiques au travers de sa politique d’intervention (solidarité interbassins). La restauration de la continuité écologique des cours d’eau est une priorité identifiée dans le cadre de la mise en œuvre de la directive cadre sur l’eau (2000/60/CE) dont l’Office français de la biodiversité facilite par ailleurs la mise en œuvre en soutenant un suivi réglementaire et scientifique spécifique aux conditions du milieu ultramarin.