Blois bénéficie d’un patrimoine naturel exceptionnel, traversée par la Loire et entourée de forêts.
Quatre zones sont identifiées comme en noyaux de biodiversité :
‐ La Forêt de Blois : Avec ses 2 750 hectares, la forêt domaniale de Blois couvre le territoire de quatre communes dont trois de la vallée de la Cisse. elle est l'une des plus belles forêts de feuillus d'Europe de l'Ouest. Une biodiversité qui se reflète dans les quelques 116 mares qu’abrite la forêt domaniale de Blois. Ces étendues d’eau attirent de nombreuses espèces et accueillent en leur sein de nombreux batraciens, dont les quatre espèces de tritons existant en France.
‐ La Loire : traverse le territoire et le coupe en deux, reconnue pour ses milieux et espèces. La Loire est concernée par deux zones Natura 2000, deux ZNIEFF, un arrêté préfectoral de protection de biotope (sternes naines et pierregarin mouettes mélanocéphales) et des sites identifies au titre des Espaces Naturels Sensibles (ENS),
- Le Cosson : est un affluent du Beuvron qu’il rejoint 1 km avant que ce dernier ne se jette dans la Loire.
‐ Le ruisseau des Mées : prend sa source dans la commune de Menars, et parcourt 4,23 km avant de rejoindre la Loire, au niveau du parc des Mées, à La Chaussée-Saint-Victor.
La foret de Russy (ZNIEFF de type 1) est aux portes Sud de la commune.
Il existe également dans les zones urbaines d’autres milieux potentiellement favorables :
‐ milieu rudéral: friches industrielles, friches agricoles.
‐ milieu herbacé: lie aux prairies de pâture, délaisses des infrastructures routières, friches agricoles (relie en ce sens le milieu rudéral).
‐ milieu boisé: arbres d'alignement, bois, bosquet.
‐ milieu aquatique: cours d'eau, étangs, mares.
‐ milieu minéralisé: route, bâti, parking.
‐ milieu cultural: cultures, gel, divers.
‐ îlots verts privés: espace végétalisé d'une maison prive (cours, jardins...)
‐ jardin familiaux: jardins communautaires regroupes.
‐ îlots verts publics ou en ZA (Zone d’activités): parcs, jardins engazonnes pouvant être plantés d'arbres.
‐ chemin: sentiers, chemins de terre, chemins empierres qui peuvent servir de corridor pour certaines espèces.
Les pressions s’exerçant sur la biodiversité sont :
• Réduction d'espaces végétalisés
• Densification du tissu urbain sans réserves de zones végétalisées
• Isolement des espaces verts
• Fragmentation des espaces verts par l'urbanisation et la création de voies de communications (risque d'isolement des coulées vertes)
• Gestion peu favorable a la biodiversité
• Urbanisation des bordures de foret
• disparition d'un espace tampon entre foret et milieu urbain extrêmement important pour la biologie de certaines espèces