Avec un territoire particulièrement attractif, à proximité directe de Montpellier et desservi par de nombreux axes de communication, l'intercommunalité du Pays de l'Or fait face à des pressions sur ses milieux naturels et son équilibre écologique. Elles sont notamment liées à l'artificialisation des terres et une pression sur les habitats naturels, du fait de l'urbanisation, des activités économiques et de la fréquentation du territoire. Pour répondre à cet enjeu, le SCOT a fixé des objectifs de limitation de la consommation foncière. L'activité agricole est également importante avec une plaine agricole historiquement orientée vers une agriculture productive à haut niveau d'intrants. Cela impacte la biodiversité et la qualité de l'eau, raisons pour lesquelles les collectivités et la profession agricole se sont engagées depuis de nombreuses années vers une évolution des pratiques agricoles. Finalement, la population importante sur le Pays de l'Or, et à fortiori en saison estivale constitue un enjeu environnemental majeur quant aux problématiques d'assainissement et de qualité des eaux de l'étang et de ses zones humides périphériques. Des investissements majeurs ont été faits dans ce domaines par l'Agglomération ces dernières années.