Proche de Honfleur, la Rivière-Saint-Sauveur se situe en bord d'estuaire de la Seine. Elle est traversée par 2 rivières, l'Orange et la Morelle qui se déversent dans l'estuaire. Une grande partie du territoire est classée Natura 2000 et Espace Naturel Sensible non accessibles pour les habitants. Les usagers sont des agriculteurs et une association de chasse qui assure une mission d'entretien du milieu. Zone de transition entre la mer, la terre et le fleuve, l'estuaire de la seine constitue un milieu naturel remarquable, malgré une artificialisation forte. La diversité des milieux (estuairiens, dunaires, aquatiques, prairiaux boisées et de côteaux) induisent une grande richesse patrimoniale en terme d'espèces. La commune comprend une grande partie urbanisée, surtout le centre bourg, et des quartiers un peu plus ruraux.