En 2018, Morne-à-l’Eau était nommée « capitale française de la biodiversité » lors de la 8ème édition du concours.
Sur les 6 500 ha de surface de la collectivité, 2 000 ha sont occupés par des espaces humides avec une mangrove, une forêt marécageuse et des prairies humides. Ces espaces sont reconnus à l’échelon national et international, car ils font partie de la réserve de biosphère et de la zone RAMSAR. Aussi, 2 800 ha du territoire appartiennent aux « Grands Fonds » autre espace remarquable qui est la plus grande ZNIEFF de Guadeloupe.