Caractériser, suivre et évaluer les espèces

  • Connaissances, données & diagnostics

France entière

La connaissance et la gestion des espèces nécessitent des approches spécifiques. Complémentaires des approches transversales ou généralistes par type de milieux, elles sont mises en œuvre en priorité lorsque l’objectif est sur la connaissance d'une espèce et de son état de conservation. Des méthodes, protocoles et outils sont proposés, et différents projets d'action ou de recherche permettent d'approfondir certains sujets.

L’Office français de la biodiversité (OFB) coordonne en effet nombreux programmes portant sur la flore et la faune sauvage et notamment les espèces protégées, migratrices, les prédateurs terrestres et les ongulés, ou suivies via ses différents réseaux (réseaux patrimoniaux, réseau de surveillance sanitaire...).

Des principes communs

Selon les objectifs visés, la problématique étudiée, les méthodes ou projets peuvent concerner une espèce précise, ou un groupe d'espèces partageant des traits biologiques ou des enjeux communs, ou un territoire.

Des plus simples aux plus complexes, les approches par espèce concernent :

  1. l’occurrence des espèces : indices de présences, identification par observations directes, captures…,
  2. la taille et les dynamiques des populations : protocoles de dénombrement, d’estimation d’abondance ou de densité,
  3. l’état des individus : traits morphologiques, état sanitaire, croissance, régime alimentaire, diversité génétique, reproduction,
  4. les comportements individuels : suivis des déplacements ou des migrations.

Pêche de suivi sur la Bérence, à Gavray (Manche) le 7/09/2020 (Nathalie Pfeiffer / OFB)

Des référentiels et outils socles

Des fiches informatives sur les espèces

Pour certaines espèces concernées par des actions de l'OFB, les informations et ressources disponibles sont rassemblées en "fiches espèces", proposant des éléments de biologie, écologie, sur la situation de l'espèce et les études menées à l'OFB, la règlementation, la documentation... et renvoient vers les autres ressources existantes (fiches INPN, centres de ressources, références bibliographiques...).

    Nommer et identifier : les référentiels Patrinat

    TaxRef, le référentiel national des noms scientifiques et vernaculaires porte sur l’ensemble des êtres vivants présents sur le territoire français et permet de parler un langage commun malgré le foisonnement des noms utilisés.

    Le projet Campanule a pour objectif de constituer un catalogue des techniques, méthodes et protocoles d’acquisition de données naturalistes en France.

    Les réseaux de suivi et de surveillance : structurer les suivis et remontées d’observation de terrain

    Espèces marines

    • Les espèces marines protégées en France - Identification et régime juridique

      • Guides et protocoles

      L’objectif de ce guide est de fournir un outil de terrain pratique pour aider les agents de contrôle dans l’exercice de leurs missions de police de l’environnement en mer. Il répertorie l’ensemble des espèces marines protégées en droit français (hors les oiseaux), sous forme de fiches donnant des éléments d'identification des espèces et leur régime juridique. À disposition : le guide en intégral, ainsi que les parties découpées par groupes d'espèces avec chaque clé d'identification associée, ou encore les 112 fiches espèces via des filtres de recherche.

    • Les mammifères marins

      • Connaissances, données & diagnostics
      • Coopération & partenariats

      En soutien aux politiques publiques nationales et européennes et aux engagements internationaux, les actions menées visent 3 objectifs : mieux connaître ces espèces, mieux les protéger, et accompagner les acteurs et usagers de la mer pour faire évoluer les pratiques et leurs impacts sur cette grande faune marine.

    À découvrir : exemple de productions issues des données récoltées

    Les documents techniques sur les espèces

      • Guide de détermination des habitats terrestres et marins de la typologie Eunis

        • Guides et protocoles

        La typologie Eunis est une classification des habitats naturels, semi-naturels et anthropiques des secteurs terrestres et marins d'Europe, utilisable dans tout l'Hexagone. Cet outil accompagne l'écologue généraliste dans ses identifications de terrain.

      • Identification rapide des adultes d'amphibiens de métropole et de Corse

        • Guides et protocoles

        Les amphibiens sont des “sentinelles” de l'état des milieux aquatiques et humides. Révisé en mars 2024, ce guide d'identification des adultes d'amphibiens de métropole et de Corse est un outil pratique pour le terrain. Il comprend une clé de détermination simple et des fiches par espèce reprenant les informations de statuts, morphologie, habitat, phénologie, répartition... utiles pour tous ceux qui souhaitent découvrir ces espèces souvent méconnues.

      • Guide pour l’interprétation des écailles et l’estimation de l’âge chez le saumon atlantique (salmo salar) dans les populations françaises

        • Guides et protocoles

        L’étude de la biologie et de l’écologie du saumon atlantique (Salmo salar L.), notamment de sa dynamique des populations et de ses stratégies d’histoire de vie, passe par l’analyse des caractéristiques démographiques. Elle nécessite l’estimation de l’âge, essentiellement réalisée à partir de structures dures à croissance périodique comme les écailles. Ce nouveau guide confirme les clés taille-âge des populations françaises actuelles, et synthétise les difficultés rencontrées pour l’interprétation des écailles.

      • La pêche scientifique à l’électricité dans les milieux aquatiques continentaux

        • Guides et protocoles

        La pêche scientifique à l'électricité est une méthode largement utilisée pour les échantillonnages piscicoles en cours d’eau. Cet ouvrage fournit les éléments de compréhension des phénomènes électriques et de la réaction des poissons soumis à un champ électrique, et synthétise l’ensemble des paramètres à prendre en compte pour réaliser ou exploiter ce type de pêche.

      • Guide pour la gestion des données " milieu marin ". De l'acquisition à la diffusion - Version 2

        • Guides et protocoles

        Collectées, bancarisées, diffusées, valorisées, les données constituent la matière première du gestionnaire d’espaces protégés. Ce guide propose une méthode de gestion des données adaptée aux enjeux de gestion de la biodiversité marine. Cette nouvelle version actualisée permet de mieux prendre en compte les évolutions des accès web, les référentiels et les nouveaux outils de bancarisation.

      • Lâchers d’eau morphogènes : guide de mise en oeuvre

        • Guides et protocoles

        Les lâchers d'eau morphogènes désignent les débits relativement élevés, libérés au niveau des barrages pour générer des changements physiques des lits des cours d'eau en aval et pour créer ou améliorer les habitats aquatiques et rivulaires. Ce guide présente une nouvelle approche pour évaluer la pertinence de ces opérations et les mettre en oeuvre.

      • Indicateurs et outils de mesure - Évaluer l’impact des activités humaines sur la biodiversité

        • Expertise et synthèse

        Les acteurs de la société - États, entreprises, citoyens, etc. - sont de plus en plus nombreux à s’engager pour estimer et limiter leurs impacts sur la biodiversité. Mais comment évaluer ces impacts et la qualité de leurs engagements visant à les réduire ? La Fondation pour la recherche sur la biodiversité (FRB) publie en collaboration avec l’OFB un rapport compilant les résultats d’une enquête, d’une évaluation scientifique d’outils de mesure intégratifs, d’ateliers ainsi que des échanges.

      • Indice de qualité écologique (IQE) - Indice de potentialité écologique (IPE) - Guide méthodologique

        • Guides et protocoles

        L’indice de qualité écologique (IQE) caractérise la biodiversité à l’échelle globale d’un site. Il a été conçu pour évaluer des sites aménagés, accueillant du public, à vocation commerciale, industrielle ou de loisirs. Applicables partout en France métropolitaine, l'IQE - et sa déclinaison l'IPE - évaluent les enjeux patrimoniaux, la fonctionnalité écologique et la diversité des espèces et des habitats.

      • Guide technique pour la mesure et la modélisation du transport solide

        • Guides et protocoles

        La morphologie des cours d’eau est directement liée au transport des particules solides dans leur lit. Or mesurer cette dynamique des fonds reste une étape difficile à réaliser. Destiné aux gestionnaires, bureaux d'étude et collectivités, ce guide propose un état de l’art sur le transport solide, ses outils de mesure et de modélisation.

        • État de conservation du loup en France - Mise à jour 2025 de la viabilité démographique de la population sous régime de tirs dérogatoires

          • Rapport d'étude & expertise

          Ce rapport d’expertise porte sur la viabilité des populations de Loup gris (Canis lupus) en France à l’horizon 2035. Coordonné par l'OFB et le Muséum national d'Histoire naturelle sur saisine interministérielle, il associe une étude prospective des populations à une analyse des impacts des tirs dérogatoires, afin d'évaluer les probabilités d'évolution des effectifs de loups.

        • Dataviz - Observer les oiseaux nicheurs et hivernants présents en métropole

          • Dataviz

          Cette datavisualisation porte sur les populations de certaines espèces d’oiseaux sauvages, essentiellement migrateurs, présents en France au moins une partie de l’année. Elle présente l’évolution de leur abondance, leur distribution et l’estimation de tendances des effectifs. Elle s’appuie sur le suivi de 20 espèces d’oiseaux de métropole (migrateurs, migrateurs partiels, sédentaires) par le réseau Oiseaux de passage (OFB/FNC/FDC). 

        • Expertise scientifique collective sur la viabilité des populations de lynx boréal en France

          • Ouvrage
          • Rapport d'étude & expertise

          Le Lynx boréal est une espèce protégée et menacée d'extinction bénéficiant de mesures de protections. Sur demande du ministère en charge l'écologie, le MNHN et l’OFB ont piloté cette expertise scientifique collective portant sur la viabilité à terme du lynx boréal en France et l’impact potentiel d’un renforcement. Les travaux identifient des obstacles à la conservation de la population française et européenne occidentale, et indique des recommandations concrètes d'action.

        • Dataviz - Regard sur 3 décennies de suivi des poissons en France métropolitaine

          • Dataviz

          Au sein de la faune d’eau douce, les poissons constituent le groupe d’espèces le plus visible et le mieux connu. Pourtant, combien d’entre nous savent quelles espèces peuplent les cours d’eau français ? L’objectif de cette datavisualisation est de mieux comprendre le suivi piscicole en France métropolitaine et ses enseignements.

        • Dataviz - Présence des ongulés sauvages en France

          • Comprendre pour agir

          La présence de plus en plus visible des ongulés sauvages dans les forêts et montagnes françaises suscite des questions et des débats. Face à la méconnaissance de ces espèces par une grande part de la population et afin de partager les connaissances acquises depuis plusieurs décennies, l’OFB publie cette Dataviz pour apporter des informations sur leur répartition, l’évolution de leur zone de présence et les données de chasse dans l’hexagone. 

        • Répartition communale de la petite faune de montagne en France : bilan de la décennie 2010-2019 et évolution depuis 1950

          • Comprendre pour agir

          Nos massifs hexagonaux abritent des populations de galliformes et de petits mammifères de montagne ayant une forte valeur patrimoniale, soumises aux actions humaines et aux effets renforcés du changement climatique. Ces enjeux de conservation nécessitent le suivi des populations et de l'évolution des aires de présence. Ce travail de l'Observatoire des galliformes de montagne (OGM) et de l'OFB révèle des situations très variées, allant de populations favorisées à d'autres en danger critique de disparition.

        • Programme d’études Colombidés - Bilans annuels

          • Rapport d'étude & expertise

          Ces documents présentent les bilans du suivi national des Colombidés mené depuis 2019 dans le cadre du programme d'étude Colombifés dédié à 4 espèces. Les résultats sont mis en perspective avec ceux des années précédentes. D'autres études plus spécifiques liées au programme sont aussi présentées : suivi des déplacements par voie satellitaire, analyses isotopiques, études des tableaux de chasse...

        • E Mufre di Corsica - Les Mouflons de Corse - Ovis gmelini musimon var. corsicana - 50 ans de travaux de recherches et d'actions de conservation

          • Comprendre pour agir

          Ce recueil sur le Mouflon de Corse expose les suivis et les expérimentations menés sur le terrain depuis 5 décennies. Il illustre la diversité des approches, l’évolution des méthodes et les résultats obtenus à travers le temps, et apporte de nouveaux éléments de réponse dans un objectif de conservation. Destiné aux naturalistes, aux gestionnaires d’aires protégées et plus largement à l’ensemble des responsables institutionnels, ce travail s’appuie sur une importante étude bibliographique de la littérature scientifique, rapports d’études,et entretiens d'experts scientifiques.

        • Reptiles endémiques et vertébrés introduits de l'archipel des Saintes - Répartition, abondance et mesures de gestion

          • Comprendre pour agir

          L’archipel des Saintes est un ensemble de neuf îles et îlets situés au sud de la Guadeloupe, il qui accueille une biodiversité atypique avec un fort taux d’endémisme. Plusieurs espèces de reptiles terrestres sont menacées d’extinction, notamment en raison des pressions imposées par les animaux introduits, qu'ils soient domestiques ou exotiques envahissants. Une étude menée de 2021 à 2023 permet de mieux connaître l’état des populations de reptiles menacés et de vertébrés envahissants, et d’identifier les actions de gestion à mettre en œuvre pour limiter le risque d’extinction.

        • Dépliants - Trois décennies d'observations et de recherche sur les poissons migrateurs ORE DiaPFC : la Bresle, l'Oir, le Scorff et la Nivelle

          • Plaquette & fascicule

          Ces dépliants complètent et actualisent l'information sur chacun des 4 bassins constituant l’Observatoire de recherche en environnement sur les poissons diadromes dans les fleuves côtiers (ORE DiaPFC) : Bresle, Oir, Scorff et Nivelle. Ils appuient l'ouvrage collectif publié en 2020 dans la collection Comprendre pour agir de l'OFB et précisent la situation des stations, les espèces suivies, les méthodes utilisées et suivis réalisés, ainsi que les atouts des 40 ans de chroniques de données.