Saint-Génis-des-Fontaines est une commune française située dans l'est du département des Pyrénées-Orientales en région Occitanie, au niveau du piémont des Albères en zone rurale. Elle fait aussi partie de l'aire d'attraction de Perpignan.
Exposée à un climat méditerranéen, elle est drainée par le Tanyari, la rivière de Laroque et par un autre cours d'eau. La commune possède un patrimoine naturel remarquable composé de deux zones naturelles d'intérêt écologique, faunistique et floristique.
